De hoofdrol in de serie is voor dr. J. Allen Hynek (Aidan Gillen), een briljante universiteitsprofessor die wordt aangenomen door de Amerikaanse luchtmacht. Hij leidt de clandestiene operatie Project Blue Book die duizenden gevallen onderzoekt. Meer dan 700 daarvan blijven tot op de dag van vandaag onopgelost. Elke aflevering verdiept zich in feitelijke casusbestanden waarin UFO-theorieën worden gecombineerd met authentieke historische gebeurtenissen in een van de meest mysterieuze tijdperken uit de geschiedenis van de Verenigde Staten.
